Porteur
Béatrice Lauga
Session
2019
Co-porteur(s)
François Rigal
Titre
METAMIC : Eléments traces métalliques et communautés microbiennes : quel impact sur le fonctionnement des tourbières dans les Pyrénées ?
Résumé
Les tourbières constituent l’un des stocks de carbone les plus importants de la planète dont la transformation pourrait aggraver l’ampleur du changement climatique. Ce sont aussi des écosystèmes emblématiques dotés d’une biodiversité originale souvent menacée du fait du changement climatique et des activités anthropiques. Les tourbières pyrénéennes situées à la limite sud de distribution de ces écosystèmes en Europe sont particulièrement concernées. Il apparait donc essentiel de mieux les connaître pour mieux anticiper leurs réponses face aux bouleversements futurs.
Les microorganismes des tourbières jouent un rôle majeur dans les transformations cycliques des éléments comme le carbone ou l’azote. Nombre de leurs métabolismes dépendent d’éléments traces métalliques (ETM) essentiels. Dans les tourbières, souvent en très faibles concentrations ou peu biodisponibles ils pourraient être un élément structurant dans le fonctionnement de ces écosystèmes en influant la production des gaz à effet de serre (GES) tels le CO2, le N2O. Cependant dans les tourbières de montagne la distribution et la disponibilité des ETM pourrait être différente du fait d’apports d’ETM plus importants provenant de l’activité minière passée, des bassins versants et des fonds géochimiques. Pour aborder cette problématique et distinguer ces deux situations, nous proposons de:
o Dresser une cartographie spatiale et temporelle des ETM.
o Caractériser l’activité des communautés microbiennes liées à la production de GES.
o Relier les activités microbiennes à la distribution des ETM.
o Initier la caractérisation de métallophores, métabolites secondaires clés pour l’acquisition d’ETM essentiels.
La tourbière de Bernadouze dans le bassin minier des Pyrénées Ariègeoise est le site modèle de ce projet.
Type
Projet OHMs
OHM(s) concerné(s)
  • Haut-Vicdessos
Disciplines
Biogéochimie, Chimie, Écologie
Image

Porteur

Béatrice
Lauga
Titres académiques
2012 Habilitation à diriger les recherches (HDR), Université de Pau et des Pays de l’Adour (UPPA)
1996 Doctorat, UPPA, Sciences biologiques
Parcours professionnel
Depuis 2013- Professeur (UPPA)
2007-2013- Maître de conférences - (UPPA).
2005-2007- Chercheuse contractuelle - (UPPA) – IPREM-EEM (Pau - France)
2003-2004- Chercheuse au Conservatoire Botanique National (Bagnères de Bigorre, France)
2001-2002- Post-doctorat - UPPA –EEM –IPREM (Pau - France)
1999-2000- Post-doctorat- University of Edinburgh – Charlesworth lab’s (Edinburgh, Ecosse)
1996-1999- Attachée temporaire enseignement et recherche (ATER) - (UPPA)
Thèmes de recherche
Mots-clés : Ecologie des communautés, diversité microbienne, changement globaux, biogéographie, évolution, adaptation, contaminants

Résumé : Après mon doctorat, j'ai été post-doctorante dans le laboratoire des Profs B. et D. Charlesworth puis à l’UPPA où j'ai commencé à m’intéresser aux microorganismes dans l'environnement. Je suis maintenant professeure. J’enseigne la biologie végétale, la génétique et la bioinformatique et je réalise ma recherche en écologie microbienne. Je suis responsable de la plateforme PREMICE (plateforme régionale dédiée à l'étude de la diversité microbienne). Je m'intéresse aux profils de diversité microbienne, à la fois taxonomique et fonctionnelle, avec un intérêt particulier sur leur rôle dans le fonctionnement des écosystèmes. J'explore une variété d'environnements pour comprendre quelles forces façonnent l’assemblage des communautés microbiennes. Mes études sont principalement focalisées sur des environnements marqués par des contaminations anthropiques. Je développe une large gamme d'outils et de méthodes pour étudier les échantillons complexes et contaminés. Mes approches sont influencées par mon expérience passée en génétique des populations et son lien avec l'écologie des communautés.

Participants

François
Rigal
Statut : Maitre de conférences (UPPA-IPREM)

Domaines de compétence : Ecologie des communautés, Biogéographie, Ecologie fonctionnelle.

Thématique de recherche : Comprendre les mécanismes écologiques et évolutifs déterminant la structure des communautés et leurs réponses aux pressions anthropiques.

Activités d’Enseignement : Enseignement des biostatistiques en Licence de Microbiologie, biologie cellulaire et moléculaire et en Master chimie et sciences du vivant Parcours biologie moléculaire et microbiologie de l'environnement.

Parcours :
Depuis Septembre 2015 : Maitre de conférences à l’université de Pau et des Pays de l’Adour.
2010-2015 : Post-doctorat. Université des Açores (Portugal)
2009-2010. Attaché temporaire à la recherche et à l’enseignement (Université Pierre et Marie Curie)
2005-2009 : Doctorat. Station biologique de Roscoff - Université Pierre et Marie Curie.

Activité éditoriale:
Editeur associé pour les revues Community Ecology et Plos One

Publications en lien avec le projet METAMIC

RIGAL, F., CARDOSO, P., LOBO, J.M., TRIANTIS, K.A., WHITTAKER, R.J. AMORIM, I.R. & BORGES, P.A.V. (2018). Functional traits of indigenous and exotic ground-dwelling arthropods show contrasting responses to land-use change in an oceanic island, Terceira, Azores. Diversity and Distributions. 24 (1) 36-47

RIQUELME, C. *, RIGAL, F.*, HATHAWAY, J.J.M., NORTHUP, D.E. BORGES, P.A.V., GABRIEL, R., AMORIM, I.R. & DAPKEVICIUS M.L.N.E. (2015). Cave microbial community composition in oceanic islands: disentangling the effect of different colored mats in diversity patterns of Azorean lava tubes. FEMS Microbial Ecology. 91(12)

CARDOSO, P., RIGAL, F. & CARVALHO, J.C. (2015). Biodiversity Assessment Tools, an R package for the measurement and estimation of alpha and beta taxon, phylogenetic and functional diversity. Methods in Ecology and Evolution. 6, 232-236
Gaël
Le Roux
Function:
CNRS researcher in BioGeochemistry
Qualifications:
Master in Environmental Geosciences, University of
Aix-Marseille, 2001
Magistère des Sciences de la Terre, University of
Lyon - ENS Lyon, 2001
PhD in Environmental Geochemistry, University of
Heidelberg (2005)
Habilitation à diriger les recherches, INP-Toulouse
(2013)
Awards:
Umwelt-Preis der Viktor und Sigrid Dulger-Stiftung
(2006)
Employment history:
CNRS researcher (Toulouse)
post-doc position, University of Liège (2008-2009)
post-doc position, Institute of Radioprotection and
Nuclear Safety (IRSN-Cadarache) (2005-2008)
Research topics:
Isotope and Trace Element Biogeochemistry,
especially in mountain area
Atmosphere-soil-organisms transfers – isotope
fingerprinting
Wetland biogeochemistry
Holocene paleo-environment
Archaeometry
Laure
Gandois
Fonctions
depuis 2014 : CR CNRS, section 30, EcoLab (UMR
5245).
2012 - 2014 : Attachée Temporaire d’Education et
de Recherche. INPT-Ecolab. Toulouse.
2010 - 2012 : Chercheuse ( SMART Fellowship).
Singapore-MIT alliance for Research and
Technology ( SMART), Singapore.
2006 - 2009 : Doctorante (Bourse Ademe). EcoLab
(UMR 5245).
Formation
2009 : Doctorat. Géochimie de l’environnement.
Université Toulouse III
2006 : Diplôme d’ingénieur en Procédé Industriels
et Environnement (Spécialité Eau et
Environnement). INSA (Institut National des
Sciences Appliquées), Toulouse.
2006 : Master Recherche. Université Toulouse III :
en procédés de l’environnement.
Activités de recherche
Cycle du carbone dans les sols et les toubières
- Matière organique dissoute (MOD) :
caractérisation, dynamique,
- Cycle du méthane
- Interaction MOD - elements traces métalliques
Laure Gandois travaille sur la tourbière de
Bernadouze depuis octobre 2012. Après un
doctorat sur les dépôts atmosphériques de métaux
sur les sols forestiers et un post doctorat sur le
fonctionnement des tourbières tropicales, ses
recherches portent actuellement sur le cycle du
carbone et des ETM dans les tourbières et les sols,
dans les Pyrénées et en Sibérie